海南黄花梨为亚热带半常绿乔木，高10-20米，最高可达25米，胸径可达80厘米，树冠伞形，分枝较低。奇数羽状复叶，15-26厘米，有小叶9-11片，多可达13片，卵形或椭圆形。
圆锥花序腋生，长4-10厘米。每年换叶一次，12月份开始落叶，翌年2月份-3月份无叶期，3月下旬至4月雨季到来时，花叶同时抽出。花期4-6个月份，花蛋黄乳白色。10-12月份果实陆续成熟，荚果为扁平椭圆形，内含种子为肾形。
木质特征
心材新切面紫红或深褐色，有犀角的质感。生长年轮明显，纹理清晰可辨，如行云流水，非常美丽。其特别之处在于，黄花梨木中常见的很多木疖（jie），这些木疖亦很平整不开裂，呈现出狐狸头、老人头及老人头毛发等纹理，美丽可人，即为人们常说的鬼脸儿。新切面气味辛辣浓郁，久则微香。气干密度：0.82-0.94g/立方厘米。
分类
海南黄花梨的分类常见有以下几种：
1、按照心材材色、大小分
海南岛的黎族人称木材的心材为\格\，根据成熟的黄花梨心材材色和大小，有油格、糠格之分。其中油格心材部分比较大，呈深褐色；而糠格心材部分小，呈红褐色或子褐色。
2、按海南黄花梨心材部分的颜色分
海南黄花梨的心材是不断由边材转化而成的，按颜色深浅可以分为浅黄、金黄、橘黄、红褐、深褐等若干种，通过颜色的不同反应出木材的相对密度、油性、气味的不同。颜色真则相对密度大、油性大、降香气味浓，反之，颜色浅则相对密度小，油性小、降香味淡。
3、按照黄花梨家具的总体外观分
大体可分为两类，浅色黄花梨和深色黄花梨。其中浅色黄花梨光泽较强，分量较轻，纹理清晰流畅。浅色黄花梨家具多件于北方；深色黄花梨油性较大，光泽不如浅色黄花梨，纹理没有浅色黄花梨清晰。深色黄花梨多见于南方。
4、按照在海南省的分布区域分
东部黄花梨：颜色较浅，分量较轻，油性较差，由于明清时期的过度采伐几近绝迹。
西部黄花梨：油性较强，油质感不会轻易减弱，价格高于东部的黄花梨。
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